液体活检如何读取癌症线索?cfDNA提取与甲基化检测|韵邦生物
血浆里提取出的 DNA 越多,肿瘤信号就越容易找到吗?如果多出来的是白细胞释放的基因组 DNA,肿瘤来源的片段反而可能更难辨认。多癌种早筛研究想从一管血里寻找线索,血浆分离、短片段回收和后续读出都影响最终能看到什么。
液体活检在血浆中找什么?
血浆中的游离 DNA(cfDNA)来自不同细胞,其中由肿瘤释放的部分称为循环肿瘤 DNA(ctDNA)。当这部分信号很少时,研究人员可以寻找特定序列变异,也可以分析 DNA 上的甲基化标记。不同组织和肿瘤可能呈现不同的标记组合,为识别异常信号和推测其组织来源提供线索。
先保住短片段,再选择读出方法
采血后及时分离血浆,有助于减少血细胞释放的基因组 DNA 混入样本。比较提取方法时,可把短片段回收和长片段背景与 DNA 总量一起观察。对于少数已明确的靶点,可考虑相应的 PCR 方法。需要同时观察多个区域时,可采用高通量测序。若目标是甲基化,前面的样本处理和建库方式也要能区分或保留这类信息。
韵邦生物核酸前处理相关试剂
用于蛋白消化 蛋白酶K(CAS 39450-01-6)可供涉及蛋白消化的核酸提取方法开发参考。比较实验条件时,可结合短片段回收情况和下游读出评估处理效果。
用于缓冲液配制 三羟甲基氨基甲烷(Tris,CAS 77-86-1)是用于维持配方 pH 的缓冲组分,可供自行配制核酸实验缓冲液时选用。
上述产品面向文中所述的科研方法开发场景。多癌种早筛研究中的异常信号仍需进一步检查,阴性结果也无法排除癌症。
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2026-11-06
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韵邦生物
